Во исполнение приказа Министра индустрии и торговли Республики Казахстан от 17 апреля 2007 года № 128 в целях повышения эффективности системы государственной экспертизы проектов, а также обеспечения процессного подхода и устойчивого механизма работы предприятия , РГП «Госэкспертиза» успешно внедрило в свою деятельность систему менеджмента качества.
По результатам проведенного совместного сертификационного аудита, определено, что система менеджмента качества РГП «Госэкспертиза» удовлетворяет всем требованиям СТ РК ИСО 9001-2001
Органом по сертификации ТОО «Центр сертификации «InterCert» выдан сертификат соответствия KZ.750019507.03.00788, который зарегистрирован в Государственном реестре Государственной системы сертификации Республики Казахстан под № 00788.